在安全议题上，建立国内和平统一机制，铲除阿布沙耶夫武装是菲律宾新政府主要任务。由于菲律宾国内存在共产党反政府武装，以及南部的极端主义势力，使得菲律宾军队和警察每年花费大量物质和人员进行围剿，但始终是“剿而不灭”。作为长期在南部生活和工作的菲律宾地方官员，深知解决之道。一方面要与菲律宾共产党展开和谈，邀请他们加入内阁；另一方面，集中有限的军费和人员打击阿布沙耶夫武装，因为该组织臭名昭著，影响了菲律宾国际形象和投资环境。
比起南海议题，国内安全问题应该是新政府关注的优先议题。杜特尔特明确表示，中国不可能主动侵犯菲律宾，美国也不可能在南海问题上保卫菲律宾，因为菲律宾也不会主动进攻中国。因此南海问题并不是中菲之间急于解决的优先议题。
在经济议题上，解决就业，吸引外国投资，改善民生，特别是大兴基础设施建设是新政府主要目标。
根据菲律宾民意调查机构“社会气象站”2016年3月3月3日-4月2日的调查，2016年第一季度，菲律宾的失业率为23.9%，为最近三年来的最高值。其主要原因是阿基诺三世政府没有有效地吸引外国投资创造就业。与东盟其他邻国相比，菲律宾吸引外国投资还差得很远。2015年菲律宾吸引外国投资为57.24亿美元，低于2014年。相反，马来西亚2015年吸引外国投资为109.6亿美元，越南为118亿美元，印尼为192.13亿美元，新加坡为653.28亿美元。而在对东盟国家的投资中，中国则是一只主要上升力量。
旅游业也是拉动就业一个重要产业。目前为止，中国是菲律宾旅游第三大来源国，2016年1-5月，中国赴菲旅游比同期增长了80%，这体现了中国游客对菲律宾新政府改善中菲关系的期望，同时，中国大量的游客将给菲律宾创造大量的就业机会。
另外，制约菲律宾经济发展一个重大瓶颈就是落后的基础设施。在杜特尔特新政府施政策略方面，大力基础设施是重点，其中包括南北铁路，环岛公路，小型机场，公交线路等。对于基础设施建设，中国拥有丰富的经验，在技术、资金和人才等方面具有比较优势。特别是一带一路倡议中，由于南海问题，菲律宾成为“落后者”，现在应该是菲律宾新政府修好与中国关系，大力发展菲律宾经济的大好时机，否则菲律宾将与东盟其他国家的差距将越来越大，让菲律宾固定在地区一体化的边缘地带，这不符合菲律宾自身国家利益。
杜特尔特新政府上台伊始，信心满满，试图在反腐败、反犯罪、反毒品、反交通拥堵等方面取得成效。同时新政府准备8月份，设立24小时全国投诉电话，充分了解广大民众的心声，提高新政府执政的针对性和有效性。对待投资，新政府准备对投资1000万比索以上的基建项目实行24小时工作落实制度。总的说来，国内问题是杜特尔特面临的主要问题，解决菲律宾国内问题离不开中国的投资和贸易，以及中国游客的贡献。而南海问题显然模糊了新政府执政焦点。因此，我们有理由期待，杜特尔特新政府执政将开启中菲关系新时代。
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